Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms