Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OPALINQ96PE5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms