Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms