Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME9Q86XW9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms