Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PBRM1Q86U86 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PBRM1Q86U86 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms