Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APTXQ7Z2E3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms