Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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USP43Q70EL4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP43Q70EL4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP43Q70EL4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP43Q70EL4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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USP43Q70EL4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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