Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM47EQ6ZV65 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms