Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms