Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms