Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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