Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCID2Q5JVF3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms