Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms