Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms