Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms