Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms