Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms