Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms