Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC96Q2M329 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms