Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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RTL8BQ17RB0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RTL8BQ17RB0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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