Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms