Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms