Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ZNF239Q16600 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ZNF239Q16600 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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