Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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