Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZFHX3Q15911 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZFHX3Q15911 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZFHX3Q15911 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZFHX3Q15911 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZFHX3Q15911 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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ZFHX3Q15911 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ZFHX3Q15911 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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