Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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