Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms