Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms