Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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