Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARHGEF6Q15052 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARHGEF6Q15052 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms