Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIN2CQ14957 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms