Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms