Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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SPIDRQ14159 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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