Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms