Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK13Q14004 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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