Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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GTF2H3Q13889 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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