Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H2Q13888 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H2Q13888 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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