Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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ITGA9Q13797 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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ITGA9Q13797 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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ITGA9Q13797 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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ITGA9Q13797 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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ITGA9Q13797 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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