Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCOA4Q13772 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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