Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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