Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms