Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms