Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms