Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF5Q13568 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms