Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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