Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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SGCGQ13326 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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SGCGQ13326 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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SGCGQ13326 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SGCGQ13326 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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