Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM28Q13263 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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