Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NME3Q13232 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NME3Q13232 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms