Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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