Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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TRAF1Q13077 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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TRAF1Q13077 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF1Q13077 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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